Der Flugplatz Münster wurde über 40 Jahre von der Akademischen Fluggruppe Zürich AFG als Halterin aufgebaut und geführt. Zusammen mit dem Verkauf des ehemaligen Militärflugplatzes an die Gemeinde Münster wurde auch eine neue, breiter abgestütze Halterschaft in Betracht gezogen, in der die AFG immer noch aktiv mitmachen, aber nicht mehr eine Mehrheit beanspruchen wollte. 
Als ideale Lösung wurde deshalb die Flugplatzgenossenschaft Münster gegründet. Entsprechend der heutigen Nutzung werden die Segelflugpiloten nach wie vor die Hauptlast des Flugplatzes tragen. Neu werden aber auch die lokalen Motorpiloten und sowohl die betroffenen Gemeinden, das lokale Gewerbe und Tourismus-Organisationen an der Trägerschaft aktiv beteiligt sein.